Αποστολή της αποθήκης είναι ο εφοδιασμός αναλωσίμων ειδών και η παραλαβή, φύλαξη και έκδοση πάγιων περιουσιακών στοιχείων του Πανεπιστημίου προς τις διάφορες διοικητικές υπηρεσίες και ακαδημαϊκά τμήματα. Διαχείριση του αποθέματος της αποθήκης γίνεται μέσω λογισμικού συνδεδεμένου με το Λογιστήριο. Αιτήματα για τα διάφορα είδη γίνονται μέσω του ηλεκτρονικού συστήματος διαχείρισης EMSservicedesk.