Ο Κωνσταντίνος Κουτσουπάκης απέκτησε πτυχίο Χημείας από την Σχολή Θετικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Κρήτης το 1998. Από το 1998 έως το 2000 πραγματοποίησε την μεταπτυχιακή του ειδίκευση στην Εφηρμοσμένη Μοριακή Φασματοσκοπία και το 2003 έγινε κάτοχος διδακτορικού διπλώματος στην Περιβαλλοντική Βιοφυσική Χημεία, από το Πανεπιστημίο Κρήτης. Μετά την στρατιωτική του θητεία εργάστηκε ως μεταδιδακτορικός ερευνητής στο Πανεπιστημίο Κρήτης και στην Ιαπωνία ως δέκτης υποτροφίας JSPS. Aπό τον Αύγουστο του 2010 εργάζεται ως Ειδικό Εκπαιδευτικό Προσωπικό (ΕΕΠ) στο Τμήμα Διαχείρισης Περιβάλλοντος του Τεχνολογικού Πανεπιστημίου Κύπρου. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα επικεντρώνονται στην μελέτη συστημάτων Περιβαλλοντικής Βιοτεχνολογίας και Θαλάσσιας Χημείας με την χρήση
[...]φασματοσκοπικών τεχνικών.